При аутоиммунном гепатите частота перехода в цирроз печени выше, а прогноз серьезнее, чем у больных хроническим вирусным гепатитом.
Следует отметить, что более чем у половины наблюдаемых больных формирование цирроза проходило латентно на фоне стабилизации процесса. Смертность выше у больных с гспатитоподобным началом, стойким холестазом, асцитом, эпизодами печеночной энцефалопатии и мостовидными некрозами в пунктатах печени. Из собственных наблюдений и данных литературы следует, что наибольшая смертность приходится на ранний (наиболее активный) период болезни. У больных, переживших критический период, прогноз значительно лучше.
Больные с невыявленным диагнозом и соответственно не получавшие лечения преднизолоном, обычно умирают от печеночной недостаточности в течение 5 лет. При терапии глюкокортикостероидами 5-летняя выживаемость составляет 80- 90%. Общая продолжительность жизни колеблется индивидуально, в среднем от 10 до 15 лет.